1.HumanHap 550+:
在包含 HumanHap 550 相同内容的基础上,研究人员可根据自己的需要加入最多 120600 个 SNPs。
2.Human Exon 510S-Duo:
包含了约 510000 个标签 SNP 。其中 330000 个标签 SNP 偏重于基因中央的 SNPs 和 nsSNPs ,其他一些有研究价值的标签 SNP 主要针对于新近报导的 CNV 区域,与药物代谢有关的基因区域和 MHC 区域。同样可以在一张芯片上平行进行 2 个样本的检测,是 HumanHap 550-Duo 的辅助产品,将这两款产品联合使用则能提供相当于 Human 1M 的全部 SNP 信息。
3.Human660W-Quad:
在一张芯片上可平行进行 4 个样品的检测,显著的增加了样本输出信息量,减少了实验操作中的误差。该芯片广泛地采用了 HumanHap550 芯片的内容,以及额外增加了 100,000 个遗传标记。 Human 660w-quad 涵盖的全基因组信息,对于已知的和新近报道的 CNV 区域来说都具有权威性。 Human 660w-quad 上的 SNPs 以约 5kb 的密度均匀分布在基因组上。针对于基因组中高多态性的 CNV 区域(片段复制区和无 SNP 的基因组区域), Human 660w-quad 设计了一些特异的靶标来进行研究。
4.Semi-Custom Human 1M -Duo+:
包含了超过一百万个探针信息,可以在一张芯片上平行进行 2 个样本的检测。该款芯片在包含 Human 1M 单样本微珠芯片内容的基础上,增加了一些新的位点,如:增加了疾病相关的 SNP 位点,灵活的选择一些基因组编码区高密度的 SNP 位点。 Human 1M -duo 在基因覆盖度方面、检测与疾病相关的 SNP 位点数目上已达到业界领先水平,同时做到了在拷贝数变异分析方面的大间距间隔情况最少。
5.HumanCytoSNP-12:
300,000 genetic markers:target abnormalities associated with more than 300 syndromes.Boosted coverage in pericentromeric regions, subtelomeric regions, and sex chromosomes.
Additional high-value targets include 400 genes involved in developmental defects, mental retardation, and other structural changes.
6.HumanCVD BeadChip:
49,000 SNP probes: targeting ~2,100 candidate genes associated with cardiovascular disease (CVD) and other associated phenotypes.
Contents:from published scientific literature, CVD pathway analysis, and recent whole-genome analysis data sets.
7.肿瘤相关 SNP 芯片( Cancer Panel):
选择约 400 个肿瘤相关基因的 >1400 个 SNP 标记,信息来源于美国 NIHSNP500 肿瘤数据库 http://snp500cancer.nci.nih.gov/ 。
8.DNA 质控芯片:
包含 360 个 SNP 位点,可以在进行大位点实验之前对样品进行质控。
9.HumanNS-12:
在一张芯片可平行做 12 个样品,每个样品可检测 13,900 个非同义 SNP 。
10.主要组织兼容性研究芯片 ( MHC Panel ):
MHC(Major Histocompatibility Complex) 主要组织相容性区域是一段 4Mb 的基因组序列,位于 Chr 6p21 上,包含了 160 个基因。这些基因中有 40% 与免疫蛋白编码相关,其中也包括了白细胞抗原基因等。 MHC 芯片针对这一区域挑选了 2,400 个平均间隔 2kb 的 SNP 标记,对该区域的 SNP 进行检测。 MHC 芯片可广泛应用于免疫,移植,疾病等相关研究。
11.iSelect 自定义 SNP 芯片:
完全根据研究需要挑选 SNP 位点进行研究。每张芯片可平行做 12 个样品,每个样品可检测 7,600 - 60,800 个 SNP 位点。
12.BovineSNP50 Genotyping BeadChip (牛全基因组分型芯片):
Illumina 公司与牛类研究专家联合开发出牛 SNP50 基因芯片,该芯片含超过 54 , 000 个靶 SNP 探针, SNP 信息来自 Illumina Genome Analzyer 测序结果和已发布的公共信息。该芯片可分析 12 个样本,是分析牛基因变异的经济有效的实验手段。牛 SNP50 基因芯片 SNP 位点的平均间隔为 51.5kb ,相较于全基因组扫描,鉴定数量性状位点,比较遗传学等其他试验方法,该方法的探针密度更高,分析更有效。
13.CanineSNP20 Genotyping BeadChip (犬全基因组分型芯片):
犬 SNP20 基因芯片中含有大量信息的 SNP 探针,平均间隔为 22362 ,可以对任何一种家养犬类进行全基因组扫描。 Illumina 公司通过与 CanFam2.0 合作,挑选出高多态性位点以鉴定不同的家养犬类种群。如果 SNP 平均密度为每兆 8 个位点,那么该芯片可包含所有的种群关联研究位点。该芯片可同时检验 12 个样本,大大节约了经费。采用 BeadArray 技术设计,及无 PCR 步骤的 Infinium 方法分析。芯片具有极好的基因覆盖率、 call rate 值和重复率。
14.EquineSNP50 Genotyping BeadChip (马全基因组 SNP 分型芯片):
该芯片含 54 , 602 个 SNP 位点,这些位点均一分布在 15 个品种马匹的全基因组序列上。芯片数据信息来自马基因组测序计划。马 SNP50 基因芯片 SNP 的平均间隔为 43.2kb 。该基因芯片可同时检测 12 个样本,为各种全基因组研究提供了可能,例如基因关联研究和鉴定数量性状位点的研究。
15.PorcineSNP60 Genotyping BeadChip (猪全基因组 SNP 分型芯片):
猪 SNP60 基因分型芯片是通过 Illumina 的 iSelect 项目与国际领先研究协会合作开发。它包含超过 60000 个 SNP 位点,以步长平均每 40kb 有一个标记,覆盖猪的基因组。此 12 样本芯片整合了多种猪的基因差异,包括杜洛克猪,长白猪,皮特兰猪和大白猪,其性价比高,能提供足够的 SNP 密度,可应用与全基因组关联研究或其他研究中,如:全基因组选择、测定遗传指数、鉴定数量性状位点、比较基因研究。
16.OvineSNP50 Genotyping BeadChip (羊全基因组 SNP 分型芯片):
羊 SNP50 基因分型芯片是通过 Illumina 的 iSelect 项目与国际羊基因组协会合作开发。它包含超过 50000 个 SNP 位点,平均每 46kb 有一个标记,覆盖整个基因组。此 12 样本芯片整合了多个羊品种基因差异,性价比高,能提供足够的 SNP 密度,可应用与全基因组关联研究或其他研究中。 |